Concurso Bioinformática EXCELente - Universidad ORT Uruguay
Extensión

Bioinformática EXCELente

El objetivo del concurso es diseñar un proyecto introductorio que desafíe a los estudiantes interesados en la carrera de Bioinformática, permitiéndoles adquirir y aplicar conceptos básicos de análisis de secuencias utilizando herramientas simples (Excel), sin requerir conocimientos previos de programación.

Esta es una competencia 100 % remota. Es posible la participación de estudiantes de cualquier departamento del país.

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  • Concurso Bioinformática

    Participación

    Estudiantes que en 2026 estén cursando 2.° o 3.° de Educación Media Superior (EMS) organizados en equipos de dos personas. Los participantes deberán inscribirse en duplas. También podrán ser acompañados por un/a docente tutor/a del liceo (opcional).

Desafío

El desafío consiste en analizar una serie de secuencias codificantes y responder ¿cuál de ellas presenta mayor similitud funcional con una proteína de Escherichia coli cuya función es conocida?

  • Concurso Bioinformática

    ¿Quiénes pueden participar?

    El desafío está dirigido a estudiantes que en 2026 estén cursando 2.° o 3.° de Educación Media Superior (EMS) de cualquier orientación salvo las opciones Creativo Artístico, General y Ciencias Sociales y Humanidades – UCA Derecho y Ciencias Políticas. También están habilitadas las opciones de bachilleratos EMS equivalentes de planes anteriores.

  • Concurso Bioinformática

    Descripción del proyecto

    El proyecto se desarrollará utilizando Excel como herramienta principal de trabajo. A los estudiantes se les proporcionará un conjunto de cinco secuencias de nucleótidos, junto con una secuencia de referencia de Escherichia coli, cuya proteína asociada se sabe que es funcional.

     Para cada una de las secuencias, los estudiantes deberán:

    1. Identificar el marco abierto de lectura (ORF).

    2. Traducir la secuencia de nucleótidos a su correspondiente secuencia de aminoácidos.

    3. Caracterizar la proteína obtenida, calculando y comparando, entre otros parámetros:

    • Longitud de la proteína (número de aminoácidos).
    • Carga neta aproximada.
    • Número de residuos hidrofóbicos.
    • Número de residuos con carga positiva y negativa.

    4. Comparar las proteínas entre sí y con la proteína de referencia de Escherichia coli, evaluando:

    • Similitud en la secuencia de aminoácidos.
    • Similitud en las características fisicoquímicas calculadas.

Origen del problema a resolver

Una empresa industrial del sector biotecnológico utiliza bacterias para optimizar un proceso productivo clave. En particular, trabaja con cepas de Escherichia coli que expresan una proteína esencial para el funcionamiento del proceso: una enzima crítica que permite mantener la eficiencia y estabilidad de la línea de producción.

Durante un proceso de escalado, surge un problema inesperado, la cepa estándar comienza a mostrar fallas de rendimiento, lo que impacta directamente en los costos y la continuidad operativa.

El equipo de I+D decide entonces explorar una alternativa, buscar una proteína funcionalmente equivalente, que pueda reemplazar a la original sin afectar el proceso industrial.

A partir de una biblioteca de ADN proveniente de distintas fuentes bacterianas, se seleccionan cinco secuencias codificantes candidatas. Ninguna está anotada funcionalmente, pero todas podrían codificar proteínas similares a la enzima de Escherichia coli utilizada actualmente.

El desafío es identificar cuál de estas secuencias tiene mayor probabilidad de producir una proteína con función equivalente, sin recurrir todavía a ensayos costosos de laboratorio.

Esta decisión le permitirá a la empresa:

  • Reducir riesgos.
  • Priorizar recursos experimentales.
  • Avanzar hacia una solución productiva más robusta.

Este proyecto reproduce una situación típica del ámbito industrial, tomar decisiones relevantes con información parcial, usando análisis simples pero bien fundamentados.

La bioinformática aparece aquí como una herramienta estratégica, capaz de reducir costos, acelerar tiempos y guiar decisiones críticas antes de entrar al laboratorio.

  • Concurso Bioinformática

    Resultado esperado

    Se busca que los estudiantes creen una planilla utilizando funciones en distintas celdas de modo que, dado un input, lo cual serían varias secuencias de ADN, obtengan de forma automática una lista de propiedades de las proteínas codificadas en dichas secuencias.

    A partir de estos análisis, los estudiantes deberán interpretar los resultados y responder la pregunta biológica, argumentando cuál de las cinco secuencias analizadas es la más similar a la proteína de Escherichia coli conocida y, por lo tanto, cuál tendría mayor probabilidad de cumplir una función similar.

  • Concurso Bioinformática

    Rol de equipo

    Ustedes forman parte del equipo de análisis bioinformático inicial, encargado de realizar un primer filtrado racional de las secuencias antes de avanzar a la etapa experimental.

    Con recursos limitados y sin herramientas de programación, deberán trabajar utilizando Excel como plataforma de análisis, aplicando principios básicos de biología molecular.

  • Concurso Bioinformática

    Propuesta

    La propuesta deberá incluir, como mínimo, la siguiente información:

    • Un archivo Excel, desarrollado por el grupo, que permita responder las preguntas biológicas planteadas. La respuesta deberá ser explícita en el Excel.
    • Un video de máximo 5 minutos, en el que expliquen el razonamiento seguido para responder cada pregunta.

     En el video deberán abordar, de forma sintética:

    •  ¿Cuál fue el hilo de pensamiento utilizado?
    • ¿Qué aspectos consideraron más relevantes durante el análisis?
    • ¿Por qué eligieron cada fórmula o procedimiento?
    • Si identifican posibles mejoras o formas más eficientes de realizar el análisis.
  • Concurso Bioinformática

    Criterios de evaluación

    Las propuestas serán evaluadas en función de:

    •  Razonamiento bioinformático (30 %)
    • Implementación técnica en Excel (25 %)
    • Análisis comparativo y resultados (20 %)
    • Comunicación y presentación (25 %)

Inscribite al concurso